Uniwersytet Warszawski - Centralny System Uwierzytelniania
Strona główna

Deep learning in life science

Informacje ogólne

Kod przedmiotu: 1000-2M23DLS
Kod Erasmus / ISCED: 11.3 Kod klasyfikacyjny przedmiotu składa się z trzech do pięciu cyfr, przy czym trzy pierwsze oznaczają klasyfikację dziedziny wg. Listy kodów dziedzin obowiązującej w programie Socrates/Erasmus, czwarta (dotąd na ogół 0) – ewentualne uszczegółowienie informacji o dyscyplinie, piąta – stopień zaawansowania przedmiotu ustalony na podstawie roku studiów, dla którego przedmiot jest przeznaczony. / (0612) Database and network design and administration Kod ISCED - Międzynarodowa Standardowa Klasyfikacja Kształcenia (International Standard Classification of Education) została opracowana przez UNESCO.
Nazwa przedmiotu: Deep learning in life science
Jednostka: Wydział Matematyki, Informatyki i Mechaniki
Grupy: Przedmioty kierunkowe na studiach drugiego stopnia na kierunku bioinformatyka
Przedmioty obieralne dla informatyki i ML
Przedmioty obieralne na studiach drugiego stopnia na kierunku bioinformatyka
Punkty ECTS i inne: 6.00 Podstawowe informacje o zasadach przyporządkowania punktów ECTS:
  • roczny wymiar godzinowy nakładu pracy studenta konieczny do osiągnięcia zakładanych efektów uczenia się dla danego etapu studiów wynosi 1500-1800 h, co odpowiada 60 ECTS;
  • tygodniowy wymiar godzinowy nakładu pracy studenta wynosi 45 h;
  • 1 punkt ECTS odpowiada 25-30 godzinom pracy studenta potrzebnej do osiągnięcia zakładanych efektów uczenia się;
  • tygodniowy nakład pracy studenta konieczny do osiągnięcia zakładanych efektów uczenia się pozwala uzyskać 1,5 ECTS;
  • nakład pracy potrzebny do zaliczenia przedmiotu, któremu przypisano 3 ECTS, stanowi 10% semestralnego obciążenia studenta.

zobacz reguły punktacji
Język prowadzenia: angielski
Rodzaj przedmiotu:

monograficzne

Skrócony opis:

Praktyczne zastosowania modeli korzystających z metod uczenia głębokiego do współczesnych problemów biologii molekularnej (Obrazowanie medyczne, bioinformatyka strukturalna, analiza sekwencji).

Pełny opis:

Przedmiot poświęcony jest praktycznym zastosowanieom metod uczenia głębokiegio (sieci konwolucyjne, rekurencyjne, oparte o transformery) do problemów współczesnej biologii molekularnej i medycyny (analiza obrazów mikroskopowych, przewidywanie struktur białek i analiza sekwencji biologicznych).

Nagrania wideo wykładów dostępne są online, laboratoria będą odbywały się na miejscu.

Literatura:

Materiały dostępne online: https://deeplife4eu.github.io/program.

Efekty uczenia się:

Studenci posiądą wiedzę o współczesnych metodach uczenia głębokiego, umiejętność implementowania modeli uczenia głębokiego i oceny ich jakości w kontekście zastosowań w biologii. Studenci zyskają też doświadczenie i kompetencje w prezentowaniu zasady działania modeli i wyników eksperymentów obliczeniowych polegających na uczeniu sieci na danych eksperymentalnych i optymalizacji parametrów takich modeli.

Metody i kryteria oceniania:

Indywidualne prace domowe (50%) i końcowy projekt zespołowy (50%), do zaliczenia wymagane jest uzyskanie 60% punktów.

Zajęcia w cyklu "Semestr letni 2024/25" (zakończony)

Okres: 2025-02-17 - 2025-06-08
Wybrany podział planu:
Przejdź do planu
Typ zajęć:
Laboratorium, 30 godzin więcej informacji
Wykład, 30 godzin więcej informacji
Koordynatorzy: Bartosz Wilczyński
Prowadzący grup: Ada Hryniewicka, Joanna Sułkowska, Bartosz Wilczyński
Lista studentów: (nie masz dostępu)
Zaliczenie: Egzamin

Zajęcia w cyklu "Semestr letni 2025/26" (w trakcie)

Okres: 2026-02-16 - 2026-06-07

Wybrany podział planu:
Przejdź do planu
Typ zajęć:
Laboratorium, 30 godzin więcej informacji
Koordynatorzy: Bartosz Wilczyński
Prowadzący grup: Ada Hryniewicka
Lista studentów: (nie masz dostępu)
Zaliczenie: Egzamin
Uwagi:

W tym roku nie będzie części wyjazdowej, która odbywała się poprzednich latach.

Opisy przedmiotów w USOS i USOSweb są chronione prawem autorskim.
Właścicielem praw autorskich jest Uniwersytet Warszawski.
ul. Banacha 2
02-097 Warszawa
tel: +48 22 55 44 214 https://www.mimuw.edu.pl/
kontakt deklaracja dostępności mapa serwisu USOSweb 7.2.0.0-a85e39876 (2026-03-10)