Uniwersytet Warszawski - Centralny System Uwierzytelniania
Strona główna

Modelowanie molekularne i obliczeniowa biologia strukturalna 2 [1000-716MM2] Semestr letni 2020/21
Laboratorium, grupa nr 1

Przejdź do planu zaznaczono terminy wyświetlanej grupy
To jest strona grupy zajęciowej. Jeśli szukasz opisu przedmiotu, zobacz stronę przedmiotu
Przedmiot: Modelowanie molekularne i obliczeniowa biologia strukturalna 2 [1000-716MM2]
Zajęcia: Semestr letni 2020/21 [2020L] (zakończony)
Laboratorium [LAB], grupa nr 1 [pozostałe grupy]
Termin i miejsce: Podana informacja o terminie jest orientacyjna. W celu uzyskania pewnej informacji obejrzyj kalendarz roku akademickiego lub skontaktuj się z wykładowcą (nieregularności zdarzają się przede wszystkim w przypadku zajęć odbywających się rzadziej niż co tydzień).
każdy wtorek, 10:15 - 12:00
sala 4.73/4.74
W.Fizyki budynek A i B CeNT II - Pasteura 5 jaki jest adres?
Terminy najbliższych spotkań: Daty odbywania się zajęć grupy. Prezentują informacje na podstawie zdefiniowanych w USOS terminów oraz spotkań.
Kliknij w datę by zobaczyć tygodniowy plan z zaznaczonym spotkaniem.
Wszystkie zajęcia tej grupy już się odbyły - pokaż terminy wszystkich spotkań.
Data i miejsceProwadzący
Liczba osób w grupie: 2
Limit miejsc: 15
Prowadzący: Bartosz Greń
Zakres tematów:

Algorytmy całkujące równania ruchu: algorytm Eulera, algorytm Verleta, algorytm żabiego skoku. Dynamika molekularna, potencjał Lennarda-Jonesa, termostat, periodyczne warunki brzegowe. Symulacje Monte Carlo. Model Isinga.

Metody i kryteria oceniania:

Ćwiczenia są na zaliczenie (zal). Zaliczenie czterech ćwiczeń:

1) Prosta dynamika molekularna. Ruch ciała w polu innego, nieruchomego ciała (np. ruch Księżyca wokół Ziemi) z porównaniem różnych algorytmów całkujących.

2) Wielociałowa dynamika molekularna. Ruch wielu wzajemnie ze sobą oddziałujących ciał.

3) Dynamika Monte Carlo na przykładzie Modelu Isinga.

4) Prosty model zwijania białka z wykorzystaniem Monte Carlo.

Opisy przedmiotów w USOS i USOSweb są chronione prawem autorskim.
Właścicielem praw autorskich jest Uniwersytet Warszawski.
ul. Banacha 2
02-097 Warszawa
tel: +48 22 55 44 214 https://www.mimuw.edu.pl/
kontakt deklaracja dostępności USOSweb 7.0.3.0-2b06adb1e (2024-03-27)