Uniwersytet Warszawski - Centralny System Uwierzytelniania
Strona główna

Przedmioty kierunkowe na studiach drugiego stopnia na kierunku bioinformatyka (grupa przedmiotów zdefiniowana przez Wydział Matematyki, Informatyki i Mechaniki)

Jednostka: Wydział Matematyki, Informatyki i Mechaniki Zestaw przedmiotów, który widzisz poniżej został zdefiniowany przez tę jednostkę. Jednostka ta nie musi mieć jednak związku z organizacją wymienionych przedmiotów (jednostką odpowiedzialną za organizację przedmiotu jest jednostka wymieniona w odpowiedniej kolumnie w tabeli poniżej). Więcej o tym przeczytasz w Pomocy.
Grupa przedmiotów: Przedmioty kierunkowe na studiach drugiego stopnia na kierunku bioinformatyka
wybierz inną grupę zobacz plany zajęć tej grupy
Filtry
Zaloguj się, aby uzyskać dostęp do dodatkowych opcji

Konkretniej - pokazuj tylko te przedmioty, dla których istnieje otwarta rejestracja taka, że możesz w jej ramach zarejestrować się na przedmiot.

Dodatkowo pokazywane są również te przedmioty, na które jesteś już zarejestrowany (lub składałeś prośbę o zarejestrowanie).

Jeśli chcesz zmienić te ustawienia na stałe, edytuj swoje preferencje w menu Mój USOSweb.
Legenda
Jeśli przedmiot jest prowadzony w danym cyklu dydaktycznym, to w odpowiedniej komórce pojawi się koszyk rejestracyjny. Ikona koszyka zależy od tego, czy możesz się rejestrować na dany przedmiot.
niedostępny (zaloguj się!) - nie jesteś zalogowany
niedostępny - aktualnie nie możesz się rejestrować
zarejestruj - możesz się zarejestrować
wyrejestruj - możesz się wyrejestrować (lub wycofać prośbę)
prośba - złożyłeś prośbę o zarejestrowanie (i nie możesz jej już wycofać)
zarejestrowany - jesteś pomyślnie zarejestrowany (i nie możesz się wyrejestrować)
Kliknij na ikonę "i" przy koszyku, aby uzyskać dodatkowe informacje.

2023Z - Semestr zimowy 2023/24
2023L - Semestr letni 2023/24
2024Z - Semestr zimowy 2024/25
2024L - Semestr letni 2024/25
(zajęcia mogą być semestralne, trymestralne lub roczne)
Opcje
2023Z 2023L 2024Z 2024L
1000-719DAV brak brak
Zajęcia przedmiotu
Semestr letni 2023/24
  • Laboratorium - 30 godzin
  • Wykład - 30 godzin
Semestr letni 2024/25
  • Laboratorium - 30 godzin
  • Wykład - 30 godzin
Grupy przedmiotu

Skrócony opis

Poznanie technik analizy i wizualizacji danych w formie statycznej oraz interaktywnej.

Strona przedmiotu
1400-216BKWN brak brak
Zajęcia przedmiotu
Semestr letni 2023/24
  • Laboratorium - 90 godzin
Semestr letni 2024/25
  • Laboratorium - 90 godzin
Grupy przedmiotu

Skrócony opis

Celem zajęć jest zapoznanie studentów z różnymi metodami pracy z białkami i kwasami nukleinowymi. Studenci oczyszczają białka z użyciem klasycznych preparatyk stosowanych przy izolacji białka ze źródła naturalnego oraz poznają metody pracy stosowane przy oczyszczaniu białek rekombinowanych z różnych systemów ekspresyjnych.

Strona przedmiotu
1100-CM brak brak
Zajęcia przedmiotu
Semestr zimowy 2023/24
  • Wykład - 30 godzin
Semestr zimowy 2024/25
  • Wykład - 30 godzin
Grupy przedmiotu

Skrócony opis
Nie podano opisu skróconego, przejdź do strony przedmiotu aby uzyskać więcej danych.
Strona przedmiotu
1400-235CHiE brak brak
Zajęcia przedmiotu
Semestr letni 2023/24
  • Wykład - 30 godzin
Semestr letni 2024/25
  • Wykład - 30 godzin
Grupy przedmiotu

Skrócony opis

Epigenetyka to nauka o tym, jak komórki kontrolują aktywność genów bez zmiany sekwencji DNA. Opisuje czynniki wykraczające poza kod genetyczny. Przedstawimy najnowszą wiedzę o podstawowych elementach epigenetycznych oraz innych cechach molekularnych wpływających na strukturę chromatyny i mechanizmy epigenetyczne.

Zmiany epigenetyczne decydują o tym, czy geny są włączone, czy wyłączone, a regulacja epigenetyczna zapewnia produkcję w komórkach tylko tych białek, które są niezbędne do ich funkcjonowania, co jest kluczowe dla różnicowania komórkowego i rozwoju organizmu. Poznasz mechanizmy odpowiedzialne za utrzymywanie modyfikacji epigenetycznych po podziałach komórkowych. Dowiesz się, czy dziedziczenie międzypokoleniowe może być niezależne od sekwencji DNA.

Przedstawimy dane ukazujące wpływ środowiska na epigenom, prowadzący do istotnych zmian w organizmie. Dowiesz się o błędach w procesach epigenetycznych, które są przyczyną zaburzeń takich jak nowotwory lub choroby metaboliczne.

Strona przedmiotu
1000-2M23DLS brak brak
Zajęcia przedmiotu
Semestr letni 2023/24
  • Laboratorium - 30 godzin
  • Wykład - 30 godzin
Semestr letni 2024/25
  • Laboratorium - 30 godzin
  • Wykład - 30 godzin
Grupy przedmiotu

Skrócony opis
Nie podano opisu skróconego, przejdź do strony przedmiotu aby uzyskać więcej danych.
Strona przedmiotu
1000-317bDNN brak brak
Zajęcia przedmiotu
Semestr zimowy 2023/24
  • Laboratorium - 30 godzin
  • Wykład - 30 godzin
Semestr zimowy 2024/25
  • Laboratorium - 30 godzin
  • Wykład - 30 godzin
Grupy przedmiotu

Skrócony opis

Celem zajęć jest przybliżenie studentom praktycznej wiedzy z zakresu głębokich sieci neuronowych. W trakcie kursu przedstawione zostaną wykorzystywane obecnie techniki, algorytmy oraz narzędzia. Poruszane metody są stosowane między innymi do problemów z dziedziny rozpoznawania obrazów i przetwarzania języka naturalnego.

Strona przedmiotu
1000-720IPZ brak brak
Zajęcia przedmiotu
Semestr zimowy 2023/24
  • Konwersatorium - 15 godzin
  • Laboratorium - 45 godzin
Semestr zimowy 2024/25
  • Konwersatorium - 15 godzin
  • Laboratorium - 45 godzin
Grupy przedmiotu

Skrócony opis

Podczas zajęć studenci w kilkuosobowych zespołach rozwiązują jeden z dwóch

problemów powiązanych tematycznie. W każdym roku jest to inny, interdyscyplinarny

problem, wymagający programowania i analizy danych. Następnie zespoły rozwiązujące

dwa różne zadania łączą się w większe zespoły i dokonują syntezy wyników obu

podzespołów. Podczas semestru studenci wymieniają się danymi i częściowymi wynikam. Przedmiot kończy się sympozjum z

prezentacjami organizowanym wspólnie z Sorboną i Uniwersytetem w Heidelbergu.

Strona przedmiotu
1400-217MNiTP brak brak
Zajęcia przedmiotu
Semestr letni 2023/24
  • Laboratorium - 60 godzin
  • Wykład - 30 godzin
Semestr letni 2024/25
  • Laboratorium - 60 godzin
  • Wykład - 30 godzin
Grupy przedmiotu

Skrócony opis

Epidemiologia nowotworów oraz czynniki środowiskowe i endogenne sprzyjające powstawaniu nowotworów; mechanizm powstawania mutacji jako podłoże rozwoju choroby nowotworowej, mechanizmy epigenetyczne (metylacja DNA, mikroRNA). Omówione zostaną także mechanizmy naprawy DNA. Cechy komórki nowotworowej, etapy nowotworzenia, najważniejsze geny krytyczne, których dysfunkcja ma znaczenie w nowotworzeniu (onkogeny, supresory), apoptoza, proteoliza, angiogeneza, przerzutowanie. Komórki macierzyste nowotworów. Rola wirusów w powstawaniu nowotworów. Diagnostyka i współczesne metody leczenia; personalizacja terapii.

Strona przedmiotu
1400-228MiFM brak brak
Zajęcia przedmiotu
Semestr letni 2023/24
  • Laboratorium - 90 godzin
Semestr letni 2024/25
  • Laboratorium - 90 godzin
Grupy przedmiotu

Skrócony opis

Zajęcia mają za zadanie zaznajomienie studentów z podstawami filogenetyki molekularnej oraz metagenomiki (analiza amplikonów), ze szczególnym uwzględnieniem ich zastosowania w badaniach środowiskowych. W ramach bloku dotyczącego filogenetyki studenci nauczą się przyrównywania sekwencji nukleotydowych i białkowych, poznają podstawowe metody rekonstrukcji drzew filogenetycznych oraz oceny ich mocy, a także zapoznają się z podstawami datowania filogenezy oraz metodami szacowania stanów ancestralnych. A ramach drugiej części zajęć nacisk zostanie położony na analizę danych środowiskowych z sekwencjonowania nowej generacji (NGS). Podczas zajęć samodzielnie przeprowadzą analizę od etapu uzyskania surowych danych, poprzez analizę ich jakości, łączenie odczytów, oraz klasyfikację taksonomiczna sekwencji, kończąc na analizach statystycznych umożliwiających powiązanie czynników środowiskowych z otrzymanymi wynikami składu gatunkowego i wskaźnikami różnorodności biologicznej.

Strona przedmiotu
1000-135MBM brak brak
Zajęcia przedmiotu
Semestr letni 2023/24
  • Ćwiczenia - 30 godzin
  • Wykład - 30 godzin
Semestr letni 2024/25
  • Ćwiczenia - 30 godzin
  • Wykład - 30 godzin
Grupy przedmiotu

Skrócony opis

Wykład dotyczy szeroko pojetego modelowania matematycznego w biologii i medycynie. Jego podstawe stanowią modele ekologiczne, budowne na bazie równan różniczkowych i różnicowych, teorii grafów i teorii gier, poszerzone o modele reakcji odpornoociowej i podstawy klasycznej genetyki (teoria Mendla) w kontekście łancuchów Markowa.

Strona przedmiotu
1100-MMCSB2 brak brak
Zajęcia przedmiotu
Semestr letni 2023/24
  • Ćwiczenia - 45 godzin
  • Wykład - 15 godzin
Semestr letni 2024/25
  • Ćwiczenia - 45 godzin
  • Wykład - 15 godzin
Grupy przedmiotu

Skrócony opis

Przedmiot poświęcony jest przedstawieniu strategii badań układów biomolekularnych z wykorzystaniem metod fizyki teoretycznej, jak i różnorodnych technik symulacji komputerowych. W szczególności poruszone zostaną zagadnienia związanie z komputerowo wspomaganym projektowaniem leków. Omówione zostaną podstawowe, jak i zaawansowane metody takie jak dokowanie molekularne, dynamika molekularna, kwantowo-klasyczna dynamika molekularna, metody wyznaczania energii swobodnej wiązania i nierównowagowa dynamiką molekularna. W trakcie laboratorium studenci wykonają trzy projekty, obejmujące najczęstsze problemy poruszane w badaniach z zakresu biofizyki obliczeniowej:

Strona przedmiotu
1100-4BM21 brak brak brak
Zajęcia przedmiotu
Semestr letni 2023/24
  • Ćwiczenia - 30 godzin
  • Wykład - 30 godzin
Grupy przedmiotu

Skrócony opis
Nie podano opisu skróconego, przejdź do strony przedmiotu aby uzyskać więcej danych.
Strona przedmiotu
1000-135PSB brak brak
Zajęcia przedmiotu
Semestr letni 2023/24
  • Ćwiczenia - 30 godzin
  • Wykład - 30 godzin
Semestr letni 2024/25
  • Ćwiczenia - 30 godzin
  • Wykład - 30 godzin
Grupy przedmiotu

Skrócony opis

Wyłozenie podstaw teoretycznych analizy stochastycznej (łancuchy Markowa, proces Poissona, procesy urodzin i smierci, procesy gałazkowe, równanie M, równania Fokkera-Plancka, Kołmogorowa, Langevina/Ito) bedzie zintegrowane z konkretnymi modelami biologicznymi (ekspresja i regulacja genów, kanały jonowe) oraz modelami teorii gier ewolucyjnych.

Strona przedmiotu
1400-225PROT-en brak brak
Zajęcia przedmiotu
Semestr zimowy 2023/24
  • Laboratorium - 90 godzin
Semestr zimowy 2024/25
  • Laboratorium - 90 godzin
Grupy przedmiotu

Skrócony opis

Fakultet dotyczy technik używanych do prowadzania analiz proteomicznych. Studenci będą oczyszczać kompleksy białkowe i analizować ich skład za pomocą spektrometrii mas. Równolegle w części teoretycznej studenci będą poznawać zastosowanie metod protomicznych do różnych zagadnień w biologii i medycyny.

Strona przedmiotu
1000-135SST brak brak
Zajęcia przedmiotu
Semestr letni 2023/24
  • Laboratorium - 30 godzin
  • Wykład - 30 godzin
Semestr letni 2024/25
  • Laboratorium - 30 godzin
  • Wykład - 30 godzin
Grupy przedmiotu

Skrócony opis

Wykład jest poświęcony komputerowej symulacji zmiennych losowych i procesów stochastycznych. Zawiera również wstęp do metod Monte Carlo, czyli algorytmów zrandomizowanych.

Strona przedmiotu
1000-2N00SID brak brak
Zajęcia przedmiotu
Semestr letni 2023/24
  • Ćwiczenia - 30 godzin
  • Wykład - 30 godzin
Semestr letni 2024/25
  • Ćwiczenia - 30 godzin
  • Wykład - 30 godzin
Grupy przedmiotu

Skrócony opis

Przedmiot ma na celu zaznajomienie studentów z inteligentnymi technikami stosowanymi do rozwiązywania problemów, które są trudne lub niepraktyczne przy zastosowaniu typowych metod programistycznych. Zajęcia przedstawiają w związku z tym między innymi metody heurystyczne, aproksymacyjne, randomizowane, bazujące na wnioskowaniu dedukcyjnym i indukcyjnym, często modelowanym poprzez analogię do tego, w jaki sposób problemy rozwiązują ludzie. Główne tematy obejmują także inteligentne metody przeszukiwania dużych przestrzeniach stanów i rozwiązań, inteligentne strategie w grach, wnioskowanie w logice i logiczne podstawy planowania, podstawy uczenia maszynowego powiązane ze sztuczną inteligencja, podstawy modelowania niepewności, jak również różne zastosowania specjalistyczne.

Strona przedmiotu
1100-3BN17 brak brak
Zajęcia przedmiotu
Semestr zimowy 2023/24
  • Ćwiczenia - 30 godzin
  • Wykład - 30 godzin
Semestr zimowy 2024/25
  • Ćwiczenia - 30 godzin
  • Wykład - 30 godzin
Grupy przedmiotu

Skrócony opis

Wykład i ćwiczenia wrowadzające w tematykę i metodologię uczenia maszynowego i modelowania sztucznych sieci neuronowych i rozwiązywania za ich pomocą praktycznych problemów. Wykład przeznaczony jest dla studentów III roku kierunku Neuroinformatyka.

Strona przedmiotu
1000-318bVR brak brak
Zajęcia przedmiotu
Semestr letni 2023/24
  • Laboratorium - 30 godzin
  • Wykład - 30 godzin
Semestr letni 2024/25
  • Laboratorium - 30 godzin
  • Wykład - 30 godzin
Grupy przedmiotu

Skrócony opis

Celem przedmiotu jest przedstawienie architektur głębokiego uczenia, technik implementacji, trenowania i debuggowania własnych sieci neuronowych przeznaczonych do rozpoznawania obrazów. Studenci zdobędą wiedzę teoretyczną, informacje na temat współczesnych badań w tej dziedzinie oraz praktyczne umiejętności związane z rozpoznawaniem obrazów.

Strona przedmiotu
1000-2N03BO brak brak
Zajęcia przedmiotu
Semestr letni 2023/24
  • Laboratorium - 30 godzin
  • Wykład - 30 godzin
Semestr letni 2024/25
  • Laboratorium - 30 godzin
  • Wykład - 30 godzin
Grupy przedmiotu

Skrócony opis

Celem zajęć jest zapoznanie studentów z tematyką intensywnie rozwijanej ostatnio dziedziny jaką jest molekularna biologia obliczeniowa. Na wykładzie zostanie położony nacisk na metody algorytmiczne analizy danych genetycznych oraz modele matematyczne stosowane w opisie zjawisk molekularnych. Wykład umożliwi udział w innych zajęciach monograficznych z tej dziedziny proponowanych na wydziale i ewentualne zaangażowanie się w prowadzone projekty badawcze.

W przypadku braku studentów obcojęzycznych, zajęcia będą prowadzone po polsku.

Strona przedmiotu
1100-2BB111 brak brak
Zajęcia przedmiotu
Semestr letni 2023/24
  • Ćwiczenia - 45 godzin
  • Wykład - 45 godzin
Semestr letni 2024/25
  • Ćwiczenia - 45 godzin
  • Wykład - 45 godzin
Grupy przedmiotu

Skrócony opis

Przedmiot jest wstępem do mechaniki kwantowej układów molekularnych

Strona przedmiotu
ul. Banacha 2
02-097 Warszawa
tel: +48 22 55 44 214 https://www.mimuw.edu.pl/
kontakt deklaracja dostępności mapa serwisu USOSweb 7.1.1.0-5cfec1137 (2024-12-11)